在反渗透设备的选择中，有一项极为重要的指标——脱盐率，它决定了产水的水质。

脱盐率是指通过反渗透RO膜从系统进水中去除可溶性杂质浓度的百分比，这个数字可以看出RO膜对于水中杂质的过滤能力。

反渗透RO膜元件的脱盐率在其制造成形时已确定，脱盐率的高低取决于反渗透膜元件表面超薄脱盐层的致密度，脱盐层越致密，脱盐率越高，同时产水量越低。如下图，聚酰胺层是真正的功能层，决定了反渗透膜的脱盐性能。

膜元件标准脱盐率是膜元件生产厂家在标准条件下所测得的脱盐率，在实际应用中因使用条件不同会升高或降低，影响反渗透膜脱盐率的因素有很多，如：

原水浓度：一定压力下，当给水的原水浓度增高，产水量会减少，这是因为供给水的渗透压变高，有效压力降低的缘故，通常浓度提高，产水量降低的同时，脱盐率也会降低；

原水温度：温度升高，水的粘度降低、扩散性增加，产水量会随着温度升高而增加，但因为温度的上升，盐的扩散速度也会增大，导致脱盐率降低；

操作压力：产水量的增加与压力成正比，由于盐透过速率受压力影响较小，脱盐率会随着操作压力的增加而上升。

回收率：在压力一定情况下，回收率增高，浓差极化现象加重，有效压力相应减少，产水量减小，同时脱盐率降低。

除此以外，还有水中有机物质、微生物、固体颗粒以及余氯等，对反渗透膜有污染作用，需要进行预处理，避免膜表面堵塞、破损导致的脱盐率降低。